Однако у Мстителей были определённые неудачи и тёмные моменты, которые они хотели бы скрыть от общественности.
1. Злодейка Лунный Дракон манипулировала Мстителями.
В "Avengers 211" было показано, что злодейка по прозвищу Лунный Дракон манипулировала Мстителями, чтобы включить в состав команды пару злодеев. Злодейка хотела покорить планету Ба-Бани и сделала все, чтобы Мстители не стали помехой в этом.
2. Хэнк Пим изнасиловал свою жену.
Уйдя из состава Мстителей, Хэнк Пим стал Жёлтым жакетом. В этот период его жена, Оса попыталась вернуть Пима в команду. Пим вышел из себя и изнасиловал свою жену.
3. Распад команды из-за действий Доктора Друида.
Доктор Друид телепатически повлиял на членов команды, чтобы они выбрали его лидером. В это время Друидом манипулировала Равонна Ренслейер. В итоге столкновение со злодейкой привело к тому, что Доктор Друид попал в поток времени, а вернувшись на Землю, команда Мстителей распалась.
4. Женщина-паук была двойным агентом.
В "New Avengers 14" было раскрыто, что Женщина-паук является двойным агентом, завербованным Гидрой и ЩИТом. Женщина-паук давала информацию обоим организациям. Войдя в состав Мстителей, Женщина-паук продолжила давать информацию о героях Гидре. А затем выяснилось, что все это время под личностью Женщины-паука скрывался Скрулл.
5. Казнили Высший Разум.
Мстители были вовлечены в войну между Ши'ар и Кри. В ходе этой войны стало известно о гнусных манипуляциях Высшего разума. Когда Мстители открыли правду, некоторые из них решили казнить Высший разум.
6. Вижн пытался захватить мир.
В событие "Absolute Vision" Вижн намеревался захватить компьютеры по всему миру, что дало бы ему огромную власть. Вижн преследовал добрые намерения, однако методы, которые он использовал, были далеки от блага.
7. Злодеи в составе команды.
В 1959 году Ник Фьюри продвигал инициативу Мстителей. И он отвечал за состав команды. Ник Фьюри включил в состав команды жестоких злодеев: Саблезубого и Крейвена-охотника. Этот состав команды распался всего через пару миссий.
8. Ребёнок Капитан Марвел.
Когда Капитан Марвел родила ребёнка, он быстро вырос до совершеннолетия. Этим ребенком был Маркус Иммортус, который затем похитил Капитан Марвел. Мстители смогли разобраться с Маркусом Иммортусом, но затем отпустили Капитан Марвел вместе с ним. Годы спустя Капитан Марвел осуждала Мстителей, которые отпустили её с человеком, который манипуляциями заставил забеременеть её.
9. Тони Старк был спящим агентом Канга Завоевателя.
В "The Crossing" было раскрыто, что Тони Старк был спящим агентом Канга Завоевателя. Используя путешествия во времени, Канг извратил разум Тони Старка ещё до создания Мстителей. Когда Старк стал Железным человеком и одним из основателей Мстителей, Канг воспользовался им, чтобы убить много людей и навредить героям.
10. Иллюминаты.
После войны Кри со Скруллами, Железный человек решает собрать команду лидеров, среди героев, которые сотрудничали с Мстителями. В состав Иллюминатов вошли: Железный человек, Профессор Икс, Мистер Фантастик, Доктор Стрэндж, Нэмор и Чёрный Гром.
Команда тайно принимала тёмные решения, скрывая это от остальных героев. Иллюминаты манипулировали другими героями, используя их в своих целях.
